हत्यारे के क्रीड शैडोज़ के प्रमुख डेवलपर ने खिलाड़ियों को आश्वासन दिया है कि एक एकल नायक चुनना कोर गेम अनुभव से समझौता नहीं करेगा। खिलाड़ी या तो नाओ, एक महिला शिनोबी, या यासुके, एक ऐतिहासिक अफ्रीकी समुराई का चयन कर सकते हैं-एक विकल्प जिसने पूर्व-रिलीज़ चर्चा उत्पन्न की है।
चिंताएं पैदा हुईं कि एक चरित्र पर ध्यान केंद्रित करने से कहानी के तत्व या गेमप्ले को याद किया जा सकता है। क्रिएटिव डायरेक्टर जोनाथन ड्यूमॉन्ट ने इन चिंताओं को संबोधित किया, अपने स्वयं के संतुलित दृष्टिकोण का वर्णन करते हुए: वह पात्रों के बीच स्विच करता है, 2-3 घंटे के लिए दूसरे पर स्विच करने से पहले एक के साथ 3-5 घंटे खेलता है।
हालांकि, ड्यूमॉन्ट इस बात पर जोर देता है कि एक चरित्र के लिए एक वरीयता समग्र अनुभव में महत्वपूर्ण रूप से बाधा नहीं होगी। जबकि प्रत्येक नायक अद्वितीय उद्घाटन अनुक्रमों और व्यक्तिगत स्टोरीलाइन का दावा करता है, खेल की कथा खिलाड़ी की पसंद के लिए अनुकूल है। वह खिलाड़ियों को अपने पसंदीदा चरित्र के रूप में खेलने के लिए प्रोत्साहित करता है:
"मुझे नहीं लगता कि आप बहुत याद करेंगे। यह वास्तव में आपकी खेल शैली पर निर्भर करता है। आप सोच सकते हैं, 'मैं देखूंगा कि खेल मेरे चरित्र की पसंद पर आधारित कैसे होता है।" प्रत्येक नायक के पास अद्वितीय परिचय और समर्पित quests हैं, लेकिन मुख्य अनुभव लचीला है।